La gestión del programa se sustenta en el trabajo coordinado de los equipos profesionales del CERLALC y la Fundación GSR, encargados de la coordinación directa de las diversas actividades en las que se estructura el proyecto. Complementando a esta labor se cuenta con el soporte de la B&M Gates Foundation, que asesora al equipo gestor a través de los profesionales de su iniciativa Global Libraries. El contacto con instituciones relacionadas con las redes de bibliotecas en la región y la conexión con los equipos que lideran proyectos análogos en otras áreas geográficas completan el marco organizativo que gobierna el desarrollo de INELI Iberoamérica.